Jedná se o soubor opatření vedoucích ke zničení mikroorganizmů způsobujících infekční onemocnění pomocí fyzikálních a chemických metod. Nejčastěji provádíme dezinfekce prostor po čištění od trusu holubů nebo hlodavců a jejich kadaverů. Dále dezinfekce suterénů domů po haváriích kanalizace, při zvýšeném výskytu plísní či jiných okolnostech zvyšujících riziko infekce. Provádíme také dezinfekce bytů po zemřelých.
Současně s dezinfekcí provádíme i odstranění zdroje výskytu infekčních mikroorganismů. Asanace suterénů, vyklizení bytů, odstranění a likvidace uhynulých živočichů.